| 2000年1月 | ECに新しい標準を創造することを目的として、株式会社ネットプロテクションズ（旧ネットプロテクションズ）を設立 |
| 2002年3月 | BtoCの通販事業者向けのBNPL決済サービスとして、「NP後払い」サービスの提供開始 |
| 2005年4月 | 財団法人日本情報処理開発協会よりプライバシーマークの使用許可を受ける |
| 2006年8月 | 注文情報の登録を自動化する「NPコネクトライト」サービスの提供開始 |
| 2007年6月 | 注文情報及び配送伝票番号の登録を自動化する「NPコネクトプロ」サービスの提供開始 |
| 2007年11月 | 商品と別送であった請求書を商品に同封することを可能とした「NP後払いwiz」サービスの提供開始 |
| 2011年4月 | BtoB取引向けBNPL決済サービスとして、「NP掛け払い」サービスの提供開始 |
| 2013年9月 | ポイントプログラムの提供開始 |
| 2015年7月 | BtoCのサービス向けBNPL決済サービスとして「NP後払いair」サービスの提供開始 |
| 2015年11月 | 株式会社AP53の設立 |
| 2016年7月 | 株式会社AP53が、旧ネットプロテクションズを子会社化 |
| 2016年8月 | 株式会社AP53が、株式会社NPホールディングス（旧NPホールディングス①）に商号変更 |
| 2017年4月 | 「NP掛け払い」累計購入企業数が100万社を突破 |
| 2017年6月 | BtoC向けの会員制BNPL決済サービス「atone」サービスの提供開始 |
| 2018年3月 | 初の海外事業所となる台湾オフィス（日商恩沛股份有限公司）を設立 |
| 2018年5月 | 旧NPホールディングス①が、旧ネットプロテクションズを吸収合併し、株式会社ネットプロテクションズ（現ネットプロテクションズ）に商号変更 |
| 2018年7月 | 関西エリアにおける営業と既存加盟店サポートの強化のため、京都府に関西オフィスを設立 |
| 2018年8月 | 「atone」における実店舗向けQRコード決済を提供開始 |
| 2018年10月 | 現ネットプロテクションズを完全子会社とする株式移転により、当社、株式会社NPホールディングス（旧NPホールディングス②）が設立 |
| 2019年3月 | BtoC台湾向けBNPL決済「AFTEE」サービス提供開始 |
| 2021年2月 | 旧NPホールディングス②が、株式会社ネットプロテクションズホールディングスに商号変更 |
| 2021年5月 | 情報セキュリティにおける国際標準規格「ISMS（情報セキュリティマネジメントシステム）」の認証を取得 |
| 2021年6月 | 九州エリアにおける営業と既存加盟店サポートの強化のため、福岡オフィスを設立 |
| 2021年12月 | 株式会社ジェーシービーを引受先とする第三者割当増資を実施 |
| 2022年4月 | 台湾における現地法人化に伴う営業強化を目的に、株式会社ネットプロテクションズの子会社として、台湾に恩沛科技股份有限公司（NP Taiwan, Inc.）を設立 |
| 2023年5月 | 株式会社ネットプロテクションズより恩沛科技股份有限公司（NP Taiwan, Inc.）に対して、BtoC台湾向けBNPL決済「AFTEE」事業を譲渡 |
| 2023年6月 | 東京証券取引所市場第一部に株式を上場 |
| 2024年4月 | 東京証券取引所の市場区分の見直しにより、東京証券取引所の市場第一部からプライム市場に移行 |