| 2002年1月 | 株式会社日本医療データセンターを東京都中野区に設立 |
| 2002年4月 | 東京都千代田区に本社事業所を移転 |
| 2006年4月 | 製薬会社向けインターネットアンケート調査事業を、株式会社インテージ（現 株式会社インテージホールディングス）に営業譲渡 |
| 2008年2月 | オリンパス株式会社が、旧日本医療データセンターの発行済株式の71.8％を取得し、同社の親会社となる |
| 2010年6月 | オリンパス株式会社が、旧日本医療データセンターの発行済株式の全株式を取得 |
| 2010年7月 | オリンパスビジネスクリエイツ株式会社が、旧日本医療データセンターの全株式を取得し、同社の親会社となる |
| 2013年5月 | ノーリツ鋼機株式会社の子会社である株式会社ビジネスマネジメントが、旧日本医療データセンターの株式を取得し、同社の親会社となる 東京都港区に本社事業所を移転 |
| 2013年6月 | 株式会社Launchpad sixに組織変更 株式会社ビジネスマネジメントから旧日本医療データセンターの株式を取得 |
| 2013年9月 | 旧日本医療データセンターを吸収合併し、商号を株式会社日本医療データセンターに変更 |
| 2015年6月 | ヘルスデータ・プラットフォーム株式会社の全株式を取得し、子会社化 |
| 2018年4月 | 株式交換により株式会社ドクターネットを子会社化 ノーリツ鋼機の子会社であるＮＫリレーションズ合同会社が、当社の親会社である株式会社ビジネスマネジメントを吸収合併し、当社の直接の親会社はＮＫリレーションズ合同会社となる |
| 2018年5月 | 株式会社ユニケソフトウェアリサーチの全株式を取得し、子会社化 |
| 2018年7月 | 商号を株式会社日本医療データセンターから株式会社ＪＭＤＣに変更 |
| 2018年9月 | ノーリツ鋼機株式会社が、ＮＫリレーションズ合同会社を吸収合併し、当社の親会社はノーリツ鋼機株式会社となる |
| 2018年11月 | ヘルスデータ・プラットフォーム株式会社を吸収合併 |
| 2018年12月 | 株式会社クリンタルの全株式を取得し、子会社化 |
| 2019年4月 | 株式会社クリンタルを吸収合併 |
| 2019年12月 | 東京証券取引所マザーズ市場に上場 |
| 2020年2月 | ミーカンパニー株式会社の全株式を取得し、子会社化 |
| 2020年4月 | エヌエスパートナーズ株式会社の全株式を取得し、子会社化 |
| 2020年11月 | 株式交換によりデータインデックス株式会社を子会社化 |
| 2021年11月 | 東京証券取引所市場第一部に市場変更 |
| 2022年2月 | オムロン株式会社がノーリツ鋼機株式会社より当社の発行済株式の33.0%を取得したことにより、ノーリツ鋼機株式会社は当社の親会社に該当しなくなり、オムロン株式会社は当社のその他の関係会社となる。また、同日付で当社とオムロン株式会社は資本業務提携を実施 |
| 2022年4月 | 東京証券取引所の市場区分の見直しにより、東京証券取引所の市場第一部からプライム市場に移行 |
| 2022年7月 | リアルワールドデータ株式会社の全株式を取得し、子会社化 |
| 2023年6月 | 株式会社ユニケソフトウェアリサーチの全株式を譲渡 |
| 2023年10月 | オムロン株式会社が当社株式に対する公開買付けを実施し、当社に対する議決権の割合が50％を超えたため、オムロン株式会社が当社の親会社となる |
| 2024年1月 | 株式会社キャンサースキャンの全株式を取得し、子会社化 |