| 1999年2月 | インターネットを中心とした各種サービスの提供を目的として、東京都新宿区に資本金1,000万円で当社を設立 |
| 1999年7月 | ショッピングカートサービス「ストアツール」提供開始 |
| 1999年9月 | レンタルサーバー「サイトサーブ」提供開始 |
| 2000年3月 | ㈱大阪有線放送社(現 ㈱USEN)と「ストアツール」「サイトサーブ」販売提携 |
| 2000年6月 | ソニーコミュニケーションネットワーク㈱(現 ソニーネットワークコミュニケーションズ㈱)、㈱ジャングルと「ストアツール」「サイトサーブ」販売提携 |
| 2001年2月 | ㈱日本レジストリサービスと業務提携 |
| 2001年9月 | ㈱大阪証券取引所ナスダック・ジャパン市場(現 JASDAQ(スタンダード)市場)に上場 |
| 2002年3月 | メルボルンＩＴ社［豪国］と業務提携 |
| 2003年6月 | 商号を「㈱イーストアー」から「㈱Ｅストアー」に変更 |
| 2004年7月 | ㈱テレウェイヴ(現 ㈱アイフラッグ)と業務・資本提携 |
| 2005年6月 | コマースリンク㈱と業務提携 |
| 2005年7月 | 事業拡大及び業務効率化を図るため、東京都港区に本店移転 |
| 2005年11月 | ヤフー㈱と業務提携 ㈱カカクコムと業務提携 |
| 2006年1月 | 独自ドメインネットショップ総合支援サービス「ショップサーブ」提供開始 |
| 2006年11月 | 商品検索サイト「ショッピングフィード」提供開始 |
| 2007年5月 | レンタルサーバー「サイトサーブ２」提供開始 |
| 2007年12月 | ベトナム・ホーチミン市にシステム開発拠点を開設 |
| 2010年10月 | Googleショッピングとパートナー契約開始 |
| 2011年9月 | Google AdWords Premier SME Partner プログラム(PSP)パートナーに認定 |
| 2012年7月 | 札幌市に事業拠点としてコールセンター「札幌マーケティングファクトリー」を開設 |
| 2015年1月 | 事業拡大のため「札幌マーケティングファクトリー」を拡張移転 |
| 2016年8月 | ショップサーブがAmazon Payに対応 |
| 2017年3月 | ショップサーブにビットコイン決済を標準搭載 12,500店舗に提供 |
| 2017年7月 | ABテストツール「Ｅストアーコンペア」提供開始 |
| 2017年9月 | メールマーケティングツール「Ｅストアークエリー」提供開始 |
| 2020年1月 | ㈱コマースニジュウイチを連結子会社化 |
| 2020年3月 | ㈱ウェブクルーエージェンシーを連結子会社化（2021年９月 ㈱ＷＣＡに社名変更） |
| 2020年9月 | 東京都港区虎ノ門に本社を移転 |
| 2020年10月 | ㈱コマースニジュウイチが東京都港区西新橋に本店移転 |
| 2020年11月 | 中期経営計画を発表 |
| 2021年4月 | ㈱コマースニジュウイチが新たなECプラットフォームサービス「ECo2(エコツー)」提供開始 |
| 2021年5月 | ショップサーブが「３Ｄセキュア2.0」に対応 |
| 2021年7月 | ㈱アーヴァイン・システムズを連結子会社化 |
| 2022年4月 | 東京証券取引所の市場区分の見直しにより、JASDAQスタンダード市場からスタンダード市場に移行 |
| 2022年8月 | ㈱SHIFFONを連結子会社化 |
| 2023年2月 | ２事業セグメント（ＥＣ事業、ＨＯＩ（ハンズオンインキュベーション）事業）での決算開示開始 |
| 2023年3月 | ショップサーブ第３世代リリース |