| 1914年3月 | 埼玉県熊谷市に松本米穀製粉㈱として設立 |
| 1930年12月 | 日東製粉㈱と改称、名古屋市の名古屋製粉㈱を合併し名古屋工場と称す |
| 1938年6月 | 埼玉県深谷市の埼玉興業㈱を合併し深谷工場と称す |
| 1938年8月 | 東京証券取引所に上場 |
| 1954年12月 | 東京芝浦の中央製粉㈱を合併し東京工場と称す |
| 1960年10月 | 東京晴海工場完成、東京工場を閉鎖集約 |
| 1963年10月 | 東京証券取引所上場規定変更に基づき、市場第二部に指定 |
| 1964年4月 | 三菱商事㈱と総代理店契約を締結 |
| 1970年5月 | 日東運輸倉庫㈱(100％出資連結子会社)を設立 |
| 1973年8月 | 東京晴海工場に製粉工程1ラインを増設し熊谷工場を閉鎖集約 |
| 1977年5月 | 日東フーズ・サービス㈱(後に日東フーズ㈱と改称、100％出資連結子会社)を設立 |
| 1979年3月 | 旧名古屋工場を閉鎖、愛知県知多市に名古屋工場を新設 |
| 1980年9月 | 東京証券取引所市場第一部に指定 |
| 1982年11月 | 深谷工場を閉鎖、埼玉県熊谷市に埼玉工場を新設 |
| 1989年3月 | 東京晴海工場を閉鎖、東京都大田区に東京工場を新設 |
| 1989年6月 | 埼玉県熊谷市に埼玉食品工場を新設 |
| 1998年8月 | 埼玉県熊谷市に食品開発センターを新設 |
| 2000年3月 | 隅田商事㈱を連結子会社化(出資比率49.1% 財務諸表等規則の改正による支配力基準の適用) |
| 2003年4月 | ㈱さわやかの全株式を取得 |
| 2003年7月 | 日東フーズ㈱と㈱さわやかを合併(合併後の名称を㈱さわやかと称す、100％出資連結子会社) |
| 2006年4月 | 富士製粉㈱と合併、合併後の名称を日東富士製粉㈱と称す 日東運輸倉庫㈱と富士製粉運輸㈱を合併(合併後の名称を日東富士運輸㈱と称す、100％出資連結子会社) |
| 2006年6月 | 三菱商事㈱と共同でベトナムにプレミックス製造の合弁子会社NITTO-FUJI INTERNATIONAL VIETNAM CO.,LTD.を設立(85％出資非連結子会社) |
| 2007年6月 | 三菱商事㈱による株式の公開買付けにより同社が親会社となる |
| 2007年10月 | 連結子会社隅田商事㈱の株式を追加取得し、100％出資連結子会社とする |
| 2009年3月 | ㈱増田製粉所の発行済株式総数の28％を取得し、同社と業務提携契約を締結 |
| 2011年11月 | 非連結子会社NITTO-FUJI INTERNATIONAL VIETNAM CO.,LTD.に追加出資(出資比率94.7％) |
| 2012年3月 | 水産飼料事業を日本農産工業㈱に譲渡 |
| 2012年4月 | NITTO-FUJI INTERNATIONAL VIETNAM CO.,LTD.を連結子会社化(出資比率94.7％) |
| 2014年3月 | 設立100周年を迎える |
| 2016年10月 | 10株を1株の割合で株式併合を実施、1単元を1,000株から100株に変更 |
| 2018年2月 | ㈱増田製粉所の株式を公開買付けにより追加取得し、同社を100％出資連結子会社とする その子会社である兼三㈱を連結子会社化 |
| 2018年11月 | タイにNitto Fuji International (Thailand) Co.,Ltd.(100％出資連結子会社)を設立 |
| 2021年10月 | 1株を2株の割合で株式分割を実施 |
| 2022年4月 | 東京証券取引所の市場区分の見直しにより市場第一部からスタンダード市場へ移行 |